Sinopsis

Berlatar pada tahun 2039, efek drastis dari pemanasan global telah menyebabkan naiknya permukaan air laut, yang mengakibatkan hilangnya banyak daratan. Untuk memastikan umat manusia mempelajari pelajarannya, armada kapal perang kuat yang dilengkapi dengan persenjataan canggih muncul, menyebabkan kekalahan luar biasa bagi pasukan angkatan laut di seluruh dunia. Menyebut diri mereka Armada Kabut, setiap kapal memiliki “Model Mental”, avatar humanoid yang mewakili jantung kapal, “Union Core”-nya. Setiap model memiliki kepribadian yang berbeda tetapi semua mengikuti otoritas yang tidak diketahui yang dikenal sebagai Kode Laksamana, yang telah menerapkan blokade untuk mencegah manusia melakukan perjalanan melintasi laut.

Tujuh belas tahun setelah blokade, Gunzou Chihaya, alumnus Akademi Kelautan Nasional, menemukan I-401 dan Model Mentalnya, Iona, yang berpihak pada umat manusia untuk alasan yang tidak diketahui. Memanfaatkan harapan baru untuk mencapai perdamaian bagi umat manusia, Gunzou dan teman-temannya membentuk sekelompok privateer, yang dikenal sebagai Baja Biru, saat mereka memulai perjalanan berbahaya.