Anime Kotoura San ini sebenarnya bercerita tentang kisah cinta dan drama dari seorang gadis SMA yang diasingkan oleh teman-teman sekelas, bahkan keluarganya karena dianggap aneh dan berbeda. Namun anime ini juga dibumbui dengan scene-scene komedi yang pastinya akan membuat kalian senyum-senyum sendiri ketika menontonnya. Nah berikut adalah sinopsis Kotoura San. Kotoura Haruka adalah gadis SMA yang mempunyai kemampuan khusus untuk membaca isi pikiran orang lain. Namun namanya juga gadis lugu, ia tidak pernah mengerti dengan kelebihan yang ia miliki sendiri tersebut. Kotoura menganggap jika isi pikiran dari orang yang ia baca tersebut sama seperti ucapan orang tersebut. Kemudian Kotoura selalu mengungkapkan apa isi pikiran dari orang-orang yang dibaca pikirannya tersebut. Padahal kan tidak semua isi pikiran dari orang harus diungkapkan, karena tentu saja ada sesuatu yang harus disembunyikan atau dirahasiakan. Karena ulahnya tersebut iaa dianggap oleh teman-temannya sebagai pembohong, karena itu juga ia dijauhi oleh teman-teman sekelasnya bahkan hingga ibu kandungnya enggan menganggap Kotoura sebagai anaknya. Bertahun-tahun kehidupan dari Kotoura penuh dengan kesedihan. Saat ia masuk SMA, ia hanya bisa pasrah dan juga siap untuk menjalani masa-masa SMA dengan kesendirian. Namun datanglah Manabe Yoshihisa seorang pria yang bisa menerima bakat terpendam dari Kotoura tersebut dan tulus membela Kotoura di hadapan orang lain yang mencoba mengucilkan Kotoura. Manabe juga membantu Kotoura agar bisa bangkit dan percaya diri. Kotoura sendiri senang dengan kehadiran Manabe, namun ia juga merasa jijik karena ternyata isi pikiran dari Manabe hanyalah fantasi erotis tentang Kotoura.