Dan kisah akan berlanjut setelah Makoto Naegi dan rekan-rekannya yang selamat melarikan diri dari Hope’s Peak Academy ke dunia luar, mereka segera bergabung dengan Future Foundation, sebuah organisasi yang didedikasikan untuk memerangi keputusasaan. Tepat ketika semua tampak melihat ke atas, Naegi ditangkap dan diadili karena pengkhianatan karena membela kelompok Remnants of Despair yang jahat. Berdiri di depan semua eksekutif Yayasan Masa Depan, dia mendapati dirinya, bersama dengan Kyouko Kirigiri dan Aoi Asahina-san, menghadapi nasib yang tidak diketahui.Masalah yang ada hanya meningkat ketika keamanan organisasi yang seharusnya tidak dapat ditembus diretas oleh wajah yang familiar: Monokuma. Yang membuat Naegi ngeri, beruang mekanik segera mengumumkan awal dari permainan pembunuhan baru, karena beberapa saat kemudian, korban pertama muncul sebagai sinyal keputusasaan untuk melanjutkan penaklukan brutalnya. Dalam kesimpulan dari kisah harapan dan keputusasaan Danganronpa yang mencekam, Naegi, Siswa Keberuntungan Tingkat Sekolah Menengah Atas, sekali lagi harus mengungkap misteri ketika rekan-rekan dan teman-temannya mulai jatuh di sekitarnya. Namun, tidak ada lagi uji coba kelas; di antara 16 peserta yang putus asa, hanya ada satu pembunuh dan kematian mereka berarti akhir dari permainan neraka ini.

Kelas 77-B yang tidak biasa di Hope’s Peak Academy akan memiliki tambahan yang lebih eksentrik: Chisa Yukizome, seorang alumni dengan gelar Pengurus Rumah Tangga Tingkat Sekolah Menengah Atas dan guru wali kelas baru mereka. Ceria, bersemangat, dan cakap, Chisa segera memperbaiki perilaku bermasalah siswa dan memperkuat hubungan mereka. Mungkin tidak mudah berurusan dengan murid yang beragam mulai dari putri dan perawat hingga yakuza dan siswa yang sangat beruntung, tetapi segalanya mungkin terjadi dengan kekuatan harapan. Sementara itu, Hajime Hinata, seorang anak laki-laki biasa-biasa saja dari Sekolah Cadangan, mendambakan bakat. Suatu hari, dia mengadakan pertemuan tak terduga dengan Gamer Kelas Super SMA Kelas 77-B Chiaki Nanami, yang memberinya pandangan hidup yang baru dan penuh harapan. Namun, tanpa sepengetahuannya, eselon atas sekolah akan menjalankan proyek jahat yang berpusat di sekitar Hajime yang akan membuat Hope’s Peak dan seluruh dunia bertekuk lutut. Zetsubou-hen menceritakan kehidupan sehari-hari yang dilakukan di akademi pengembangan bakat, dan kegelapan yang mengintai di bawahnya. Saat keputusasaan perlahan-lahan menginfeksi harapan, rencana dijalankan untuk memulai Peristiwa Terbesar, Paling Mengerikan, Paling Tragis dalam Sejarah Manusia, dan akhirnya dimulai.

Pada akhirnya Sekarang dicap untuk mati dan ditakdirkan untuk diburu oleh iblis sampai hari kematiannya, Guts memulai perjalanan untuk menentang nasib yang mengerikan, ketika gelombang binatang buas mengejarnya tanpa henti. Memperkuat tekadnya, dia mengambil pisau mengerikan Pembunuh Naga dan bersumpah untuk membalas dendam pada orang yang bertanggung jawab, memburu pria yang pernah dia kagumi dan anggap sebagai teman. Sepanjang jalan, ia bertemu beberapa sekutu yang tidak mungkin, seperti peri kecil bernama Puck, dan Isidro, seorang pencuri muda yang ingin belajar ilmu pedang dari mantan tentara bayaran. Saat kelompok ragtag perlahan bersatu setelah memutuskan untuk bergabung dengan Guts dalam pencariannya, mereka akan menghadapi bahaya yang luar biasa tidak seperti apa pun yang pernah mereka alami sebelumnya.

Menginjak di usianya yang baru 12 tahun, Takumi Harada sudah dipuji sebagai pelempar baseball yang luar biasa. Tetapi ketika keluarganya pindah ke kota terpencil Nitta, Takumi tidak punya pilihan selain bergabung dengan tim bisbol sekolah barunya yang tidak terampil. Perkembangan ini tidak banyak berpengaruh pada bocah itu, karena dia percaya akan lebih menarik jika klub tanpa nama ini menjadi pembangkit tenaga listrik karena kehadirannya. Namun, karena bakatnya yang luar biasa, Takumi membutuhkan seorang penangkap yang mampu mengimbangi lemparannya. Akhirnya Kekhawatirannya segera hilang setelah bertemu Gou Nagakura. Sebagai penggemar dan sesama muridnya, Gou ingin membuktikan bahwa dia bukan pembual biasa, melainkan pemain yang cukup terampil untuk menangkap lemparan Takumi. Di tengah berjuang untuk membentuk “baterai” dengan Gou, Takumi mengalami konflik dengan rekan satu tim barunya karena kepribadiannya yang tidak sopan tetapi bergulat untuk menemukan kegembiraan sejati dari olahraga di bawah bimbingan kakeknya.

Cerita di awal saat di atas meja dapur yang tidak mencolok dengan tenang tergantung seikat pisang kuning matang. Tiba-tiba, salah satu buah ramping mulai bergetar, mula-mula dengan lembut tetapi perlahan-lahan meningkatkan keganasan sampai memisahkan diri dari yang lain. Dengan pendaratan yang anggun, makanan panjang dan melengkung yang dapat dimakan secara bertahap menggulung kembali kulit emasnya, mengungkapkan apa yang ada di bawah penutupnya yang kuat untuk menjadi … seekor kucing? Hibrida kucing-buah misterius ini bernama Bananya. Tanpa beban dan lembut, makhluk menggemaskan itu bermimpi suatu hari nanti menjadi pisang lezat yang bermandikan cokelat. Bersama dengan sesama bananya, anak kucing berjubah kuning ini melewati hari-harinya tanpa peduli di dunia, menikmati keberadaan yang agak tenang dan damai saat ia mengalami apa yang ditawarkan dunia.